I år 1615 stiger en ny Shogun til magten i Japan og stræber efter at bringe fred til riget. I sin kamp mod oprør rekrutterer han fem specialister med ekstraordinære færdigheder til mord, sabotage og spionage. En del af dette hold er Hayato, en adræt ninja, der lydløst rydder vej gennem sine fjender med sværd og shuriken. Samurai Mugen er lidt mere ligetil og kan besejre flere modstandere på én gang på bekostning af fleksibilitet. Aiko er en mester i camouflage, når hun distraherer fjender som en Geisha, og gadebarnet Yuki placerer fælder og lokker fjenderne mod deres dødelige skæbne. Takuma er imidlertid afhængig af sin snigskytteriffel og tager sig af fjenderne på afstand.
I dette taktikspil i realtid skal spilleren omhyggeligt evaluere sine muligheder for at mestre de udfordrende missioner: hvordan vil figurerne opføre sig som et hold? Hvilken er bedst rustet til hver opgave? Hvordan kan de mestre de givne miljøer bedst? Kom med din egen geniale taktik for at besejre fjender og fuldføre missioner.
